Phó Thủ tướng Vũ Văn Ninh, đồng thời là Trưởng Ban chỉ đạo Tây Nam Bộ yêu cầu, trong thời gian tới, các bộ, ngành cố gắng bổ sung những luận cứ phù hợp để tăng cường tiềm năng và lợi thế phát triển đảo Phú Quốc. Mặt khác, trong thời gian chờ đề án được duyệt, Phú Quốc phải thực hiện các cơ chế, chính sách hiện hành.
Tại hội nghị, nhiều ý kiến được đưa ra nhằm tháo gỡ những khó khăn, vướng mắc trong hoạt động thu hút đầu tư, trong đó có những vấn đề thuộc thẩm quyền của Thủ tướng Chính phủ, để từ đó xây dựng cơ chế, chính sách riêng cho đảo Phú Quốc, thúc đẩy đầu tư, áp dụng cơ chế ưu đãi cao nhất cho từng lĩnh vực đầu tư cụ thể cho "đảo ngọc" Phú Quốc.
Với vị trí nằm ở tiền tiêu phía Tây Nam Tổ quốc, đảo Phú Quốc được đánh giá vừa có tiềm năng phát triển kinh tế to lớn, vừa có vị trí quân sự đặc biệt quan trọng trong chiến lược phòng thủ đất nước. Theo phê duyệt quy hoạch tổng thể của Thủ tướng Chính phủ về phát triển kinh tế xã hội tỉnh Kiên Giang đến năm 2020 xác định mục tiêu phát triển Phú Quốc trở thành đặc khu kinh tế hành chính vào năm 2020.
Theo quy hoạch, phát triển Phú Quốc thành trung tâm du lịch sinh thái, nghỉ dưỡng, giải trí cao cấp quốc gia và quốc tế; trung tâm tài chính tầm cỡ khu vực; là đầu mối quan trọng về giao thông vận tải nội vùng và hàng không quốc tế; là trung tâm nghiên cứu khoa học công nghệ chuyên ngành; bảo tồn đa dạng sinh học rừng và biển của quốc gia và khu vực; có vị trí đặc biệt về an ninh và quốc phòng. Đến năm 2020, dự kiến dân số Phú Quốc khoảng 340.000-380.000 người, thu hút 2-3 triệu lượt khách; đến năm 2030 dân số Phú Quốc khoảng 500.000-550.000 người, thu hút 5-7 triệu lượt khách.
Để Phú Quốc phát triển xứng tầm là “đảo ngọc" của quốc gia, Ban chỉ đạo Tây Nam Bộ kiến nghị Chính phủ cần ban hành ngay trong năm 2013 các cơ chế chính sách phát triển đảo Phú Quốc như thành lập Khu kinh tế biển Phú Quốc và cụm đảo Nam An Thới; ngoài các cơ chế, chính sách, pháp luật được hưởng theo quy định riêng, Phú Quốc còn phải được áp dụng các cơ chế, chính sách ưu đãi cao nhất mà nhà nước ban hành (về đầu tư trong và ngoài nước, đầu tư khu công nghiệp, khu kinh tế thương mại tự do, khu kinh tế mở…).
Bên cạnh đó, Chính phủ cần kéo thời hạn lưu trú miễn thị thực của người nước ngoài, du khách đến Phú Quốc từ 15 ngày lên 30 ngày; kiến nghị cho người Việt định cư ở nước ngoài được mua nhà ở gắn với quyền sử dụng đất ở trên đảo; ban hành cơ chế hấp dẫn thu hút vốn đầu tư trong và ngoài nước với mức ưu đãi cao hơn 1,5 lần khung ưu đãi trong các quy định hiện hành.