Thừa ủy quyền của Chủ tịch nước, Bí Thư Thành ủy, Chủ tịch HĐND TP Lê Văn Thành đã trao tặng thầy, cô trường PTTH Trần Phú Huân chương lao động Hạng Nhất. Bí thư Thành ủy, Chủ tịch HĐND TP biểu dương thành tích đáng tự hào, sự đóng góp không mệt mỏi của các thế hệ cán bộ, giáo viên, học sinh trường chuyên Trần Phú trong 30 năm dạy và học với mong muốn thầy cô, nhà trường luôn là điểm sáng của khối THPT toàn TP và cả nước.
Từ khi đi vào dạy và học, trường PTTH chuyên Trần Phú đã trở thành một trong những trường hàng đầu của cả nước về chất lượng đào tạo, 21 năm liên tiếp có học sinh tham dự các kỳ thi Olympic quốc tế. Trong đó có 33 giải quốc tế gồm 7 huy chương vàng, 11 huy chương bạc, 11 huy chương đồng cùng 4 bằng khen của các giải Olympic toán, lý, hóa và tin học quốc tế. Đối với giải quốc gia, các thế hệ học sinh của nhà trường đạt gần 900 giải cùng nhiều giải thi Đường lên đỉnh Olympia. Với thành công đã đạt được, năm 2004, nhà trường vinh dự đón nhận danh hiệu Anh hùng lao động thời kỳ đổi mới.
Từ năm học 2016 - 2017, trường PTTH chuyên Trần Phú được TP đầu tư hơn 300 tỷ đồng để xây dựng khu trường mới tại Khu đô thị mới Ngã Năm - Sân bay Cát Bi. Nhà trường được đầu tư xây mới đồng bộ các hạng mục như phòng học, khu hiệu bộ, nhà đa năng, bể bơi, sân bóng đá.