Đồng thời, Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an đã ra quyết định khởi tố bị can đối với: Nguyễn Minh Tuấn (nguyên vụ trưởng Vụ trang thiết bị và công trình y tế thuộc Bộ Y tế); Nguyễn Nam Liên (Vụ trưởng Vụ Kế hoạch tài chính, Bộ Y tế); Trịnh Thanh Hùng (Phó Vụ trưởng Vụ Khoa học và Công nghệ các ngành kinh tế kỹ thuật, Bộ Khoa học và Công nghệ). Các bị can này bị khởi tố về tội "Lợi dụng chức vụ quyền hạn trong thi hành công vụ."
Mở rộng điều tra, Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an còn xác định một số lãnh đạo, cán bộ Trung tâm kiểm soát bệnh tật tỉnh Nghệ An (CDC Nghệ An) và Trung tâm kiểm soát bệnh tật tỉnh Bình Dương (CDC Bình Dương) đã thông đồng, câu kết với Phan Quốc Việt và các đối tượng liên quan thuộc Công ty Việt Á, Công ty Trách nhiệm hữu hạn Phát triển Công nghệ ứng dụng Việt Nam (Công ty VNDAT) trong vụ nâng giá sinh phẩm xét nghiệm COVID-19.
Kết quả điều tra ban đầu xác định các bị can đã vi phạm các quy định của Luật Đấu thầu khi tổ chức đấu thầu mua vật tư phòng, chống dịch COVID-19, gây hậu quả đặc biệt nghiêm trọng.
C03 đã khởi tố các bị can Nguyễn Văn Định (Giám đốc CDC Nghệ An); Nguyễn Thị Hồng Thắm (Kế Toán trưởng CDC Nghệ An); Nguyễn Thành Danh (Giám đốc CDC Bình Dương); Trần Thanh Phong (Phó phòng Tài chính Kế toán CDC Bình Dương); Lê Thị Hồng Xuyên (nguyên phụ trách Phòng Thí nghiệm CDC Bình Dương); Tiêu Quốc Cường (kế toán trưởng, phó phòng tài chính Sở Y tế Bình Dương).
C03 cũng khởi tố 3 bị can là lãnh đạo, nhân viên các công ty gồm Nguyễn Trường Giang (Giám đốc Công ty VNDAT); Nguyễn Thị Thuý (nhân viên kinh doanh Công ty VNDAT) và Lê Trung Nguyên (Giám đốc Vùng Công ty Việt Á). Các bị can bị C03 khởi tố điều tra về tội "Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng."
Theo C03, ngoài hành vi đã khởi tố, kết quả điều tra đến nay xác định bị can Phan Quốc Việt (Tổng Giám đốc Công ty Việt Á ), Vũ Đình Hiệp (Phó giám đốc Công ty Việt Á) và Phạm Duy Tuyến, giám đốc CDC Hải Dương còn có hành vi đưa, nhận hối lộ số tiền 27 tỷ đồng.
Do đó, C03 quyết định khởi tố bị can đối với Phan Quốc Việt, Vũ Đình Hiệp về tội Đưa hối lộ; khởi tố bị can đối với Phạm Duy Tuyến về tội "Nhận hối lộ."
Sau khi được Viện kiểm sát nhân dân tối cao (Vụ 3) phê chuẩn, Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an đã thi hành các quyết định và Lệnh nêu trên.
Hiện Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an đang tiếp tục điều tra mở rộng đối với các cá nhân, đơn vị liên quan để làm rõ bản chất của vụ án, yếu tố tư lợi...; Rà soát, kê biên, phong tỏa tài sản của các đối tượng để đảm bảo triệt để thu hồi cho Nhà nước.
