Theo văn bản ký kết, căn cứ vào chức năng nhiệm vụ, hai bên sẽ thường xuyên trao đổi thông tin về các hoạt động ứng dụng công nghệ thông tin trong ngành y tế và của tổ chức Công đoàn. Trung tâm Thông tin Y tế Quốc gia hỗ trợ Công đoàn Y tế Việt Nam triển khai các phần mềm ứng dụng công nghệ thông tin; cập nhật các phần mềm, bảo vệ an toàn thông tin mạng và duy trì cơ sở dữ liệu Công đoàn ngành y tế. Đồng thời, duy trì hệ thống quản lý điều hành, văn bản điện tử cho các công đoàn cơ sở trực thuộc Công đoàn Y tế Việt Nam và Công đoàn ngành y tế tỉnh, thành phố kết nối liên thông hệ thống V-Office do Bộ Y tế triển khai.
Hai bên cùng phối hợp tổ chức các hoạt động đào tạo, tập huấn, bồi dưỡng kiến thức về ứng dụng công nghệ thông tin, chuyển đổi số cho đoàn viên và người lao động ngành y tế. Tuyên truyền về an toàn thông tin, thực hiện Luật An ninh mạng, nâng cao nhận thức chuyển đổi số y tế. Cùng nắm bắt thông tin về tâm tư, nguyện vọng, ý kiến của đoàn viên công đoàn và đề xuất chính sách về ứng dụng công nghệ thông tin trong ngành y tế.
Xây dựng hệ thống quản lý tổ chức, hoạt động của công đoàn ngành y tế các cấp và phối hợp triển khai dự án thẻ ngân hàng, tích hợp thẻ đoàn viên, chương trình phúc lợi đoàn viên và quản lý hồ sơ sức khỏe điện tử của đoàn viên công đoàn.
Về phối hợp xây dựng ứng dụng dành riêng cho đoàn viên công đoàn ngành y tế, bao gồm các chức năng chính như: thanh toán viện phí không dùng tiền mặt; quản lý hồ sơ sức khỏe điện tử; quản lý thông tin và định danh đoàn viên; đánh giá sự hài lòng của đoàn viên; khảo sát ý kiến của đoàn viên, người lao động. Triển khai, hướng dẫn quản lý, sử dụng chữ ký điện tử đáp ứng các yêu cầu của pháp luật về giao dịch điện tử.
Đồng thời, phối hợp tổ chức các hội thi về đẩy mạnh ứng dụng công nghệ thông tin trong ngành y tế, qua đó biểu dương, khen thưởng những đề tài, sáng kiến cải tiến ứng dụng côn nghệ thông tin nhằm nâng cao hiệu quả của công tác y tế.
Nguyên tắc phối hợp làm việc là bình đẳng, thống nhất, thực hiện đúng nhiệm vụ, quyền hạn, phù hợp với đặc điểm riêng của mỗi đơn vị, tuân theo quy định của pháp luật. Căn cứ chức năng, nhiệm vụ của từng đơn vị và tình hình thực tiễn để thực hiện những nội dung. Công đoàn Y tế Việt Nam và Trung tâm Thông tin y tế Quốc gia, Bộ Y tế xây dựng kế hoạch từng năm phối hợp cụ thể trong giai đoạn 2023-2028.
Hàng năm tổ chức sơ kết đánh giá kết quả thực hiện kế hoạch, xác định các nội dung ưu tiên phối hợp trong năm và giai đoạn tiếp theo. Chủ động đề xuất nội dung, giải pháp triển khai và cam kết thực hiện những hoạt động đã phối hợp hàng năm và trao đổi thông tin thường xuyên để cùng hỗ trợ trong quá trình thực hiện bảo đảm hiệu quả.
Cũng trong ngày làm việc, Công đoàn Y tế Việt Nam đã công bố Quyết định số 508/QĐ-CĐYT ngày 6.9.2023 về việc thành lập Công đoàn cơ sở Trung tâm Thông tin y tế Quốc gia trực thuộc Công đoàn Y tế Việt Nam và Quyết định số 510/QĐ-CĐYT ngày 6.9.2023 về việc chỉ định Ban chấp hành, Ủy ban Kiểm tra Công đoàn lâm thời Công đoàn cơ sở Trung tâm Thông tin y tế Quốc gia.
Công đoàn cơ sở Trung tâm Thông tin Y tế Quốc gia có tư cách pháp nhân; có con dấu riêng; chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức theo Luật Công đoàn và Điều lệ Công đoàn Việt Nam quy định.
Ban chấp hành Công đoàn Trung tâm Thông tin Y tế Quốc gia gồm 7 ủy viên và Phó giám đốc Trung tâm Nguyễn Trường Nam được chỉ định làm Chủ tịch Ban Chấp hành lâm thời.