Theo đó, công ty TNHH Yamaha Motor Việt Nam có hành vi vi phạm hành chính do khai sai dẫn đến tăng số tiền thuế được hoàn, thiếu số thuế phải nộp nhưng người nộp thuế đã ghi chép kịp thời, đầy đủ các nghiệp vụ kinh tế làm phát sinh nghĩa vụ trên sổ kế toán, hóa đơn, chứng từ.
Với hành vi vi phạm trên, Công ty TNHH Yamaha Motor Việt Nam bị áp dụng hình thức xử phạt tiền. Cụ thể, phạt theo quy định tại điểm c khoản 2 điều 138 Luật Quản lý thuế số 38/2019/QH14 ngày 13.6.2019 và khoản 1, điều 16 nghị định 125/2020/NĐ-CP ngày 19.10.2020 của Chính phủ do có hành vi kê khai sai dẫn đến thiếu số thuế phải nộp.
Công ty bị phạt tiền 92,3 triệu đồng theo quy định tại khoản 3, điều 16 và khoản 3 điều 12 Nghị định 125/2020/NĐ-CP ngày 19.10.2020 của Chính phủ do có hành vi khai sai khai không đầy đủ chỉ tiêu liên quan đến xác định nghĩa vụ thuế trong hồ sơ thuế, hồ sơ khai thuế của ác từ khai thuế GTGT tháng 12.2022 và từ tháng 1.2023 đến tháng 12.2023. Đối với tờ khai từ tháng 5.2021 đến tháng 12.2021 và từ tháng 1.2022 đến tháng 11.2022 do đã hết thời hiệu xử phạt do đó đoàn thanh tra không xử phạt theo quy định.
Phạt tiền 1,5 lần số tiền thuế GTGT, TNDN trốn theo quy định tại khoản 2, điều 17, nghị định 125/2020/NĐ-CP ngày 19.10.2020 do có hành vi sử dụng hóa đơn không hợp pháp, số tiền 347.724 đồng.
Về các biện pháp khắc phục hậu quả, Cục thuế Hà Nội yêu cầu công ty TNHH Yamaha Motor Việt Nam phải nộp đủ số tiền thuế còn thiếu vào Ngân sách Nhà nước. Trong đó, thuế GTGT là 112.792.776 đồng; thuế TNDN là 1.641.289.714 đồng. Ngoài ra, công ty phải nộp tiền chậm nộp tiền thuế với người nộp thuế theo quy định số tiền là 875.399.936 đồng. Ngoài ra, công ty được khấu trừ thuế GTGT chuyển kỳ sau giảm 46.031.183 đồng.
Số tiền chậm nộp thuế nêu trên được tính đến hết ngày 31.12.2024. Người nộp thuế có trách nhiệm nộp toàn bộ số tiền phạt khi nhận được quyết định xử lý của cơ quan thuế và tự tính tiền chậm nộp kể từ ngày 1.1.2025 đến ngày nộp đủ số tiền vào Ngân sách Nhà nước.
