Theo đó, qua thanh tra, cơ quan chức năng phát hiện một số vấn đề gồm:
Công ty kê khai khấu trừ đối với hóa đơn mua vào của Người nộp thuế có thông báo không hoạt động tại địa chỉ đã đăng ký của Cơ quan thuế; đối với hóa đơn kê khai sai thuế suất trong giai đoạn áp dụng NĐ 15/2022/NĐ-CP; đối với hóa đơn kê khai sai thuế suất trong giai đoạn áp dụng NĐ 44/2023/NĐ-CP.
Công ty kê khai bổ sung hồ sơ khai thuế GTGT các tháng từ 03 đến 12.2022, từ tháng 2.2023 đến 12.2023 (sau thời điểm công bố quyết định thanh tra) giảm giá trị hàng hóa, dịch vụ bán ra do xuất hóa đơn điều chỉnh các hóa đơn hàng hóa khuyến mại do Công ty xác định đảm bảo theo quy định của pháp luật về thương mại.
Về Thuế Thu nhập doanh nghiệp (TNDN): Công ty hạch toán chi phí được trừ đối với khoản chi hạch toán chi phí trong kỳ kết chuyển từ TK 3331 không tương ứng với Thuế GTGT không được khấu trừ trong kỳ tại các tờ khai thuế GTGT; Giảm chi phí được trừ đối với khoản chi có hóa đơn mua vào của người nộp thuế có thông báo không hoạt động tại địa chỉ đã đăng ký của Cơ quan thuế.
Trước tồn tại trên, Cơ quan quản lý về thuế yêu cầu Công ty chấn chỉnh ngay và điều chỉnh số liệu kê khai, điều chỉnh sổ sách kế toán và các tài khoản có nội dung liên quan ngay sau khi nhận được kết luận thanh tra để làm cơ sở kê khai, hạch toán cho kỳ sau.
Bên cạnh đó, cơ quan quản lý về thuế yêu cầu Công ty Cổ phần Thương mại Bia Sài Gòn Miền Bắc nộp ngay thuế truy thu, tiền phạt, tiền chậm nộp.
Cụ thể, tiền thuế truy thu qua thanh tra, số tiền: 6.692.117.862 đồng. Trong đó: + Số tiền thuế TNDN (TM 1052): 4.597.397.528 đồng. + Số tiền thuế GTGT (TM 1701): 192.822.870 đồng. Số tiền thuế TNCN (TM 1001): 1.901.897.464 đồng
Tiền phạt khai sai mức 20% trên số thuế tăng thêm qua thanh tra (TM 4254) do có hành vi kê khai sai dẫn đến thiếu số tiền thuế phải nộp thuế TNDN và thuế GTGT, số tiền: 958.044.080 đồng.
Tiền phạt khai sai mức 20% trên số thuế tăng thêm qua thanh tra (TM 4268) do có hành vi kê khai sai dẫn đến thiếu số tiền thuế phải nộp thuế TNCN, số tiền 380.379.493 đồng.
Tiền phạt hành vi khai sai căn xác định nghĩa vụ thuế đối với 15 hồ sơ thuế khai thuế GTGT (Công ty kê khai tờ khai bổ sung sau khi đoàn thanh tra công bố quyết định thanh tra) nhưng không dẫn đến thiếu số tiền thuế phải nộp (TM 4254): -106.600.000 đồng
Tiền chậm nộp tiền thuế TNDN (TM 4918), số tiền: 498.170.883 đồng theo quy định tại Điểm a, Khoản 2, Điều 59, Luật số 38/2019/QH14 ngày 13.6.2019 của Luật Quản lý thuế và Khoản 2 Điều 16 Nghị định số 125/2020/NĐ-CP ngày 19.10.2020 của Chính phủ.
Số tiền chậm nộp tiền thuế nêu trên được tính đến hết ngày 18.10.2024. Yêu cầu Công ty Cổ phần Thương mại Bia Sài Gòn Miền Bắc tự tính và nộp số tiền chậm nộp tiền thuế kể từ ngày 19.10.2024 đến ngày nộp đủ số tiền thuế chậm nộp vào ngân sách Nhà Nước.
Tổng số tiền thuế truy thu, tiền phạt và tiền chậm nộp là: 8.635.312.318 đồng (Tám tỷ, sáu trăm ba mươi lăm triệu, ba trăm mười hai nghìn, ba trăm mười tám đồng).
Dữ liệu doanh nghiệp thể hiện, Công ty Cổ phần Thương mại Bia Sài Gòn miền bắc là Công ty con của Sabeco với tỷ lệ sở hữu 94.72%. Doanh nghiệp đi vào hoạt động từ năm 2006, người đại diện pháp luật hiện tại là ông Trương Văn Tuấn.
