Theo Quyết định, Viện Nghiên cứu Khoa học Y Dược lâm sàng 108 được giao đào tạo các chuyên ngành gồm:
- Gây mê hồi sức
- Ngoại khoa/Ngoại lồng ngực
- Ngoại khoa/Ngoại tiêu hoá
- Ngoại khoa/Chấn thương chỉnh hình và tạo hình
- Nội khoa/Nội tim mạch
- Nội khoa/Nội tiêu hoá
- Nội khoa/Nội hô hấp
- Nội khoa/Da liễu
- Bệnh truyền nhiễm và các bệnh nhiệt đới
- Điện quang và Y học hạt nhân
- Khoa học thần kinh
- Răng – Hàm – Mặt
Được biết, Viện Nghiên cứu Khoa học Y Dược lâm sàng 108 (Viện NCKHYDLS 108) là phiên hiệu chức năng thứ hai của Bệnh viện TWQĐ 108, thực hiện nhiệm vụ đào tạo sau đại học đến bậc học tiên sĩ và nghiên cứu khoa học về y dược lâm sàng.
Năm 1995, Viện NCKHYDLS 108 được Thủ tướng Chính phủ giao nhiệm vụ đào Tiến sĩ. Từ đó đến nay Viện đã đào tạo được gần 500 Tiến sĩ trong và ngoài quân đội trên khắp cả nước.
Năm 2021, thực hiện nghị quyết số 19-NQ/TW của Ban Chấp hành TW Đảng khoá XII, Viện NCKHYDLS 108 đã dừng tuyển sinh đào tạo hệ dân sự phục vụ CNH, HĐH đất nước.