Theo Quyết định, Phó Thủ tướng Thường trực Chính phủ Nguyễn Hòa Bình làm Trưởng Ban. Phó Trưởng Ban gồm: Bộ trưởng Bộ Nội vụ Phạm Thị Thanh Trà (Phó Trưởng Ban Thường trực); Bộ trưởng, Chủ nhiệm Văn phòng Chính phủ Trần Văn Sơn.
Ban Chỉ đạo là tổ chức phối hợp liên ngành có chức năng giúp Thủ tướng Chính phủ nghiên cứu, chỉ đạo, phối hợp giải quyết các vấn đề quan trọng, liên ngành trong việc thực hiện sắp xếp, tổ chức lại đơn vị hành chính (ĐVHC) các cấp và xây dựng mô hình tổ chức chính quyền địa phương 2 cấp.
Ban Chỉ đạo có nhiệm vụ nghiên cứu, đề xuất với Thủ tướng Chính phủ phương hướng, giải pháp để giải quyết những vấn đề quan trọng, liên ngành trong việc thực hiện sắp xếp, tổ chức lại ĐVHC các cấp và xây dựng mô hình tổ chức chính quyền địa phương 2 cấp. Giúp Thủ tướng Chính phủ chỉ đạo, đôn đốc các bộ, cơ quan ngang bộ, cơ quan thuộc Chính phủ và UBND tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương trong quá trình tổ chức thực hiện, bảo đảm theo đúng quy định của Trung ương, Quốc hội, Ủy ban Thường vụ Quốc hội và Chính phủ.
Về nhiệm vụ cụ thể, Bộ trưởng Bộ Nội vụ: Tham mưu, trình Chính phủ để trình Quốc hội ban hành Luật sửa đổi, bổ sung Luật Tổ chức chính quyền địa phương năm 2025; Luật sửa đổi, bổ sung Luật Cán bộ, Công chức; tham mưu, trình Chính phủ để trình UBTVQH ban hành Nghị quyết về sắp xếp, tổ chức lại ĐVHC các cấp; hướng dẫn việc lập hồ sơ đề nghị xét công nhận Vùng an toàn khu, Xã an toàn khu, Xã đảo; rà soát, công nhận là ĐVHC thuộc diện nghèo, đặc biệt khó khăn vùng bãi ngang, ven biển và hải đảo; rà soát, điều chỉnh các chính sách thuộc lĩnh vực lao động - xã hội và chính sách đối với người có công tại ĐVHC thực hiện sắp xếp; thực hiện nhiệm vụ cơ quan Thường trực Ban Chỉ đạo theo quy định tại Quy chế hoạt động của Ban Chỉ đạo; tham mưu tổ chức các cuộc họp, các hoạt động khác của Ban Chỉ đạo và Trưởng Ban Chỉ đạo; chủ trì, phối hợp với các bộ, cơ quan trung ương có liên quan trong việc đôn đốc xây dựng đề án của các địa phương; tổ chức thẩm định liên ngành; trình Chính phủ để trình Quốc hội, UBTVQH hồ sơ đề án sắp xếp ĐVHC các cấp của địa phương, bảo đảm tiến độ và chất lượng theo quy định; hướng dẫn việc quản lý công tác văn thư, lưu trữ khi sắp xếp, sáp nhập ĐVHC cấp tỉnh và tổ chức lại ĐVHC cấp xã.
Bộ trưởng Bộ Tư pháp: Tham mưu, trình Chính phủ để trình Quốc hội ban hành Luật sửa đổi, bổ sung Luật Ban hành văn bản quy phạm pháp luật; trình Quốc hội ban hành Nghị quyết xử lý một số vấn đề liên quan đến chuyển tiếp thực hiện nhiệm vụ, quyền hạn và tổ chức bộ máy của chính quyền địa phương khi sắp xếp, tổ chức lại ĐVHC các cấp và tổ chức chính quyền địa phương 2 cấp; ban hành văn bản hướng dẫn xử lý vấn đề phát sinh thuộc lĩnh vực hộ tịch, đăng ký biện pháp bảo đảm khi thực hiện sắp xếp, tổ chức lại ĐVHC các cấp.
Trong Quyết định, Ban Chỉ đạo cũng giao nhiệm vụ cụ thể cho lãnh đạo các Bộ: Quốc phòng; Công an; Tài chính; Nông nghiệp và Môi trường; Xây dựng; Văn hóa, Thể thao và Du lịch; Khoa học và Công nghệ; Dân tộc và Tôn giáo; Y tế; Giáo dục và Đào tạo. giao chịu trách nhiệm xem xét, giải quyết theo thẩm quyền khó khăn, vướng mắc và theo đề xuất, kiến nghị của các địa phương; trường hợp vượt quá thẩm quyền thì báo cáo Trưởng ban Chỉ đạo, Thủ tướng Chính phủ, Chính phủ xem xét.
