Cụ thể, từ đầu năm 2024 đến nay, cơ quan thuế TP. Hồ Chí Minh đã tiếp nhận 981 hồ sơ hoàn thuế GTGT, tương ứng số thuế đề nghị hoàn là 15.384 tỷ đồng. Với 801 hồ sơ đã xử lý, tương ứng số thuế đã hoàn 6.878,8 tỷ đồng, tỷ lệ hồ sơ được giải quyết đã đạt 81,6%; trong đó, hoàn thuế trước, kiểm tra sau là 425 hồ sơ, tương ứng số tiền 3.030,9 tỷ đồng (chiếm 43% về số tiền xử lý hoàn) và số hồ sơ kiểm tra trước, hoàn thuế sau là 376, tương ứng số tiền 3.848 tỷ đồng (chiếm 57% về số tiền xử lý hoàn).
Hiện Cục Thuế TP. Hồ Chí Minh đang tiếp tục giải quyết 442 hồ sơ, tương ứng 4.635 tỷ đồng; trong đó, số hồ sơ hoàn thuế trước đang xử lý là 78 hồ sơ, tương ứng số tiền đề nghị hoàn là 370,6 tỷ đồng (chiếm 7,5% về số tiền đề nghị hoàn) và số hồ sơ kiểm tra trước, hoàn thuế sau là 337 hồ sơ, tương ứng số tiền đề nghị hoàn là 4.186,4 tỷ đồng (chiếm 92,5% số tiền đề nghị hoàn).
Theo phân loại hồ sơ hoàn thuế trong 9 tháng qua, số lượng hồ sơ đề nghị hoàn thuế thuộc thẩm quyền giải quyết của Cục Thuế TP. Hồ Chí Minh được nhập vào ứng dụng QLRR phân hệ hoàn thuế để phân loại hồ sơ hoàn thuế tự động là 735 hồ sơ.
Cụ thể, số hồ sơ được phân loại hoàn thuế trước, kiểm tra sau là 391 hồ sơ (tỷ lệ 53%); còn lại 354 hồ sơ được chuyển sang kiểm tra trước hoàn thuế (tỷ lệ 46%); trong đó, số hồ sơ phân loại kiểm tra trước, hoàn thuế sau theo luật định (hoàn lần đầu) là 132 hồ sơ (tỷ lệ 18,7%), số hồ sơ phân loại rủi ro chuyển kiểm tra trước hoàn là 142 hồ sơ (tỷ lệ 30%).
Báo cáo về công tác rà soát hồ sơ hoàn thuế thuộc diện kiểm tra trước hoàn đang quá thời hạn, Cục Thuế TP. Hồ Chí Minh cho biết, đã thực hiện rà soát, xử lý 374 hồ sơ có đề nghị hoàn trước ngày 31.7.2023 thuộc danh sách giám sát của Ủy ban Tài chính - Ngân sách Quốc hội. Trong đó, cơ quan thuế đã ban hành quyết định hoàn thuế đối với 221 hồ sơ (chiếm tỷ lệ 59,1%); có 91 hồ sơ đã rút, hủy đề nghị hoàn hoặc không được hoàn thuế (chiếm tỷ lệ 24,3%). Số hồ sơ còn tồn đang giải quyết là 62 hồ sơ (chiếm tỷ lệ 16,6% về số hồ sơ và 17,35% về số tiền đề nghị hoàn thuế), gồm 2 hồ sơ đang thẩm định pháp chế, 3 hồ sơ đã kết thúc kiểm tra, 18 hồ sơ vướng chính sách và đã có thông báo tạm dừng giải quyết, 1 hồ sơ chuyển cơ quan công an, 15 hồ sơ đang thực hiện kiểm tra, 11 hồ sơ người nộp thuế đề nghị hoàn nhiều kỳ và đang chờ kết quả giải quyết các hồ sơ trước hoặc đang thanh tra, kiểm tra sau hoàn, 1 hồ sơ đang thực hiện xác minh tại nước ngoài.
Cục Thuế TP Hồ Chí Minh hiện đang nỗ lực đẩy nhanh công tác xử lý đối với các hồ sơ hoàn thuế, theo đó, sẽ tổ chức các buổi làm việc trực tiếp giữa lãnh đạo Cục Thuế và các trưởng/phó phòng phụ trách các phòng thanh tra, kiểm tra, các chi cục thuế quận, huyện, khu vực và TP. Thủ Đức để cùng phân tích, đề ra phương hướng giải quyết, xử lý cụ thể các vướng mắc đối với từng hồ sơ, đảm bảo hoàn thành dự toán hoàn thuế theo đúng tiến độ kế hoạch được giao.